本發(fā)明涉及一種藻?菌共生系統(tǒng)凈化豬廠廢水的方法，具體為從養(yǎng)豬廢水中分離近具刺鏈帶藻，保存于培養(yǎng)基中，置于搖床上培養(yǎng)24小時，光強5000?8000lux，溫度10?35℃；取培養(yǎng)至對數(shù)生長期的微藻離心10min，使用超純水重懸浮，重復三次，濃縮備用；在豬廠廢水中投放步驟(2)中微藻，加入水凈化細菌，控制所有添加微藻的處理中藻體密度為0.1g/L，按藻體：菌體(根據各菌劑的有效活菌數(shù))比約為1：1計算水凈化細菌的添加量。本發(fā)明減少了污染物的排放，提高了生豬養(yǎng)殖過程中的資源利用率。