本發(fā)明公開了一種復(fù)合微生物菌劑及其制備方法與應(yīng)用。該復(fù)合微生物菌劑包括芽孢桿菌、包埋載體和交聯(lián)劑，芽孢桿菌通過交聯(lián)劑固定于所述包埋載體中。制備方法包括：將芽孢桿菌接種至含菲的培養(yǎng)基中好氧培養(yǎng)，得到菌液；將菌液濃縮，加至包埋載體中，得到含菌液的混合液，然后將含菌液的混合液逐滴滴入至交聯(lián)劑中，進(jìn)行交聯(lián)硬化形成芽孢桿菌凝膠菌球；然后進(jìn)行好氧培養(yǎng)，得到復(fù)合微生物菌劑。本發(fā)明的復(fù)合微生物菌劑，能在含高濃度Pb2+的情況下快速高效降解廢水中的高濃度菲；制備方法具有工藝簡單、生產(chǎn)成本低等優(yōu)點(diǎn)。