本發(fā)明涉及一種微藻細(xì)胞的萃取系統(tǒng)及方法，屬于微藻萃取技術(shù)領(lǐng)域。所述系統(tǒng)依次連接的至少兩級(jí)萃取分離單元，所述萃取分離單元包括依次連接的低滲液萃取室、真空分離室，微藻細(xì)胞依次經(jīng)過(guò)第一級(jí)萃取分離單元中的低滲液萃取室、真空分離室后，再進(jìn)入第二級(jí)萃取分離單元中的低滲液萃取室、真空分離室。本發(fā)明利用微藻細(xì)胞代謝響應(yīng)機(jī)理的生態(tài)特征，在保證微藻細(xì)胞活性和生物相對(duì)穩(wěn)定的同時(shí)，從微藻細(xì)胞中萃取代謝產(chǎn)物的混合液，并設(shè)計(jì)了配套的裝置，大幅度提高了微藻細(xì)胞的采收和萃取效率，顯著降低了微藻細(xì)胞中代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)成本。