本發(fā)明公開了一種從發(fā)酵液中分離氨基酸碳酸鹽的方法，對含氨基酸碳酸鹽的發(fā)酵液進(jìn)行微濾，分別得到微濾濃縮液以及微濾透過液；將微濾透過液進(jìn)行超濾處理，得到超濾濃縮液以及超濾透過液；將氨基酸碳酸鹽超濾透過液進(jìn)行納濾處理，得到納濾濃縮液；將納濾濃縮液加入活性碳脫色，得到脫色后的氨基酸碳酸鹽清液；向脫色后的氨基酸碳酸鹽清液中加入氧化鈣或氫氧化鈣，沉淀溶液中的碳酸根離子，對混合溶液進(jìn)行固液分離，分別得到碳酸鈣沉淀以及氨基酸清液，將氨基酸清液采用蒸發(fā)和溶析結(jié)合的方法結(jié)晶，得到氨基酸精品。本發(fā)明方法，不影響氨基酸鹽成品純度，且不需要經(jīng)過離子交換、脫氨等工序，縮短了提取工藝路線，廢水產(chǎn)生量少，降低了提取成本。