本發(fā)明公開(kāi)了一種降解畜禽糞便中抗生素的方法，該方法首先通過(guò)具有抗性的短小芽孢桿菌、鞘氨醇單胞菌、黑曲霉和綠色木霉對(duì)畜禽糞便中抗生素進(jìn)行第一次發(fā)酵降解，然后再利用分解藻劑結(jié)合紅外輻射技術(shù)進(jìn)一步將抗生素降解成小分子物質(zhì)，最后通過(guò)二次發(fā)酵產(chǎn)生的高溫將微生物進(jìn)行滅活。該方法能有效降解畜禽糞便中的抗生素為小分子無(wú)毒物質(zhì)，還能殺滅糞便中的蟲卵，從根本上解決了畜禽糞便中抗生素對(duì)環(huán)境的危害，同時(shí)經(jīng)過(guò)二次發(fā)酵的畜禽糞便還能制作為有機(jī)肥，循環(huán)利用，變廢為寶。