一種化學結(jié)構(gòu)輔助標引系統(tǒng)，包括：化學結(jié)構(gòu)特征提取模塊、定義模塊、關(guān)聯(lián)模塊和存儲模塊，所述化學結(jié)構(gòu)特征提取模塊用于從輸入的文獻提取化學結(jié)構(gòu)特征；所述定義模塊根據(jù)所述化學結(jié)構(gòu)特征提取模塊提取的所述化學結(jié)構(gòu)特征，定義基本單元以及所述基本單元與所述化學結(jié)構(gòu)特征的連接位置；所述關(guān)聯(lián)模塊將所述化學結(jié)構(gòu)特征提取模塊提取的所述化學結(jié)構(gòu)特征以及所述定義模塊定義的基本單元和連接位置與所述存儲模塊中存儲的數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)，從而完成收集和標引工作。通過本發(fā)明的化學結(jié)構(gòu)輔助標引系統(tǒng)，能夠提高檢索效率、增加檢索便利性、降低標引成本。