本實用新型涉及生物化學儀器技術領域，提供了一種毛細管清洗裝置。該裝置包括儲液杯、雙向泵、布液管件、集液槽和紫外檢測器，所述布液管件包括進液管以及多個與所述進液管連通的出液管；所述雙向泵的進口與儲液杯連通，所述雙向泵的出口與布液管件的進液管連通，每個所述布液管件的出液管均套接有連接軟管，所述連接軟管用于與對應的待清洗的毛細管的進口連通；所述集液槽的側壁的上部開設有多個用于插設毛細管出口的插孔，所述集液槽的下部開設有排液口，所述排液口與紫外檢測器的進口連通。本實用新型不僅能夠保證附著在毛細管內壁的檢測液被清洗干凈，而且還能避免清洗液殘留在毛細管內壁，實現(xiàn)毛細管的重復利用，降低毛細管的使用成本。