用于鑒別大銀魚和太湖新銀魚的引物及其鑒別方法，涉及用于魚種間鑒別的引物及其鑒別方法。用于鑒別大銀魚和太湖新銀魚的引物對為HLJCHI33和引物對為HLJCHI37。鑒別方法：一、無損傷采集樣本并編號；二、提取樣本基因組DNA；三、PCR反應：以引物對HLJCHI33或HLJCHI37進行PCR反應；四、凝膠電泳，即實現(xiàn)對大銀魚和太湖新銀魚的鑒別。本發(fā)明能夠對早期階段的大銀魚與太湖新銀魚進行鑒別和區(qū)分，群體鑒定比例100％，排除比例100％。具有準確性高，技術重復性好，性價比高的優(yōu)勢，可以同時對大量樣本進行檢測。