本發(fā)明提供了一種基于地質(zhì)微生物群落特征的監(jiān)控油藏的方法，屬于油藏工程技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明根據(jù)不同深度的地層會產(chǎn)生其特有的菌種的種類以及豐度來構(gòu)建產(chǎn)液剖面圖，再根據(jù)所述產(chǎn)液剖面圖計(jì)算有效裂縫高度；所述計(jì)算有效裂縫高度的方法包括：以所述不同地層的產(chǎn)液貢獻(xiàn)率的平均值作為閾值，閾值在產(chǎn)液剖面圖上以虛線標(biāo)記，超過閾值的地層判定為裂縫延伸的有效地層，所有有效地層的深度之和為有效裂縫高度。根據(jù)所述有效裂縫高度能夠監(jiān)控整個油藏，實(shí)現(xiàn)優(yōu)化井距、評估井間連通性、縫高監(jiān)測和產(chǎn)出剖面測試，為最大限度地提高油藏經(jīng)濟(jì)性的目的提供了基礎(chǔ)。