本發(fā)明公開了一種微藻篩選方法及系統(tǒng),該方法包括:將待篩選的微藻藻株分別置于微藻培養(yǎng)裝置中的若干光生物反應(yīng)器中培養(yǎng);微藻培養(yǎng)裝置中氣體分配單元上的可控出氣管和至少一個(gè)恒溫水槽,為每個(gè)光生物反應(yīng)器中的微藻藻株提供設(shè)定流量的光合反應(yīng)氣體和設(shè)定的培養(yǎng)溫度;放置在光生物反應(yīng)器側(cè)面的燈架,為微藻藻株提供設(shè)定強(qiáng)度的均勻光照;性能檢測(cè)設(shè)備獲取每個(gè)光生物反應(yīng)器中培養(yǎng)的微藻藻株并進(jìn)行生物性能指標(biāo)檢測(cè),實(shí)現(xiàn)篩選出生物性能指標(biāo)最佳的微藻藻株。能夠?qū)Σ煌N類的微藻藻株和相同種類的微藻藻株在不同培養(yǎng)條件下的生物性能指標(biāo)進(jìn)行準(zhǔn)確的評(píng)價(jià)、比較和篩選,實(shí)現(xiàn)了微藻的高效、快速、批量化篩選。