本發(fā)明公開基于強化學習的蛋白質(zhì)動態(tài)配體通道最優(yōu)路徑分析方法，包括如下步驟：獲取所述蛋白質(zhì)的靜態(tài)配體通道信息和全原子動態(tài)信息，篩選組成通道的部分原子的動態(tài)性并引入三維空間下的柵格法和原子碰撞檢測機制，構造仿真環(huán)境；構建強化學習模型，所述強化學習模型包括狀態(tài)、智能體、動作和獎勵；當配體分子走出三維空間柵格地圖的邊界則給當前狀態(tài)一個負的反饋值并返回上一狀態(tài)繼續(xù)訓練，直至到達通道終點或者達到單輪最大探索步數(shù)，則本輪訓練結束，輸出本輪訓練結果；繼續(xù)下一輪訓練，直至所有訓練輪次全部結束，輸出蛋白質(zhì)動態(tài)配體通道最優(yōu)路徑。本發(fā)明能夠協(xié)助配體分子找到到達催化活性中心位置的最優(yōu)路徑，具備一定的工程應用參考價值。