本發(fā)明公開了一種基于作用模式的人類發(fā)育毒性預(yù)測的方法，屬于化學(xué)品的人類發(fā)育毒性虛擬篩選與活性預(yù)測領(lǐng)域。包括構(gòu)建化合物活性數(shù)據(jù)集，基于人類發(fā)育毒性作用模式，選取了有害結(jié)局路徑，收集了有害結(jié)局路徑信號通路上的研究事件及其活性數(shù)據(jù)；并基于所述數(shù)據(jù)集構(gòu)建第一預(yù)測模型；然后利用若干種具有體內(nèi)實驗數(shù)據(jù)的化合物，以及利用所述第一預(yù)測模型對具有體內(nèi)實驗數(shù)據(jù)的化合物進行預(yù)測的預(yù)測結(jié)果，利用樸素貝葉斯算法訓(xùn)練得到第二預(yù)測模型；將待測化合物輸入到所述第一預(yù)測模型中進行定性預(yù)測，并將定性預(yù)測結(jié)果輸入所述第二預(yù)測模型，完成對化學(xué)品的人類發(fā)育毒性進行預(yù)測。本發(fā)明可以對潛在基于作用模式的人類發(fā)育毒性化學(xué)品進行高通量篩查。