本發(fā)明公開一種基于異質(zhì)圖的藥物?蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測方法，包括：S1.通過獲取來自Drugbank、SIDER等數(shù)據(jù)庫的藥物，靶點(diǎn)以及疾病等信息，與已有的公開數(shù)據(jù)集進(jìn)行匹配整合，構(gòu)建藥物和靶點(diǎn)相關(guān)的異質(zhì)圖，并通過RDKit計(jì)算和基于成對的Smith?waterman得分獲得藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)信息和蛋白質(zhì)序列信息。S2.結(jié)合節(jié)點(diǎn)表示與圖級表示之間的互信息以及子結(jié)構(gòu)表示與圖級表示之間的互信息，從異構(gòu)信息中學(xué)習(xí)精確的和可解釋的特征嵌入，提出了一個(gè)端到端的多視圖自動(dòng)編碼器模型完成鏈路預(yù)測的任務(wù)。本發(fā)明對于藥物重定向具有有益的科學(xué)指導(dǎo)作用，有利于發(fā)現(xiàn)潛在的藥物?蛋白質(zhì)靶點(diǎn)有效鏈接，加快舊藥新用的節(jié)奏。