本申請涉及一種微流控芯片與試劑盒及其應(yīng)用方法；所述微流控芯片的基體設(shè)有定位槽、樣本腔、裂解液儲存腔、樣本裂解腔、清洗液儲存腔、洗脫液儲存腔、緩沖腔、核酸腔、廢液腔、分發(fā)管道及至少二PCR反應(yīng)腔；基體還設(shè)有蛋白酶溶液儲存腔、混合腔、過濾區(qū)及選擇腔。應(yīng)用于檢測可以設(shè)置PCR反應(yīng)腔的數(shù)量，將熒光PCR檢測方法與微流控技術(shù)相結(jié)合，使兩種技術(shù)的優(yōu)勢互補的同時又規(guī)避了兩者的缺點，不存在樣本或化學(xué)試劑泄露的可能性，亦大大降低核酸污染的可能性，能快速準(zhǔn)確地鑒定樣本中的相關(guān)病原菌，尤其適合實現(xiàn)多重檢測，節(jié)省了實驗時間及成本；且對操作環(huán)境、人員技能等要求低，高度自動化、耗時少，又能兼顧檢測的特異性、靈敏度等性能指標(biāo)。