本發(fā)明公開了一種使用計算機(jī)模擬金屬配合物與DNA相互作用的方法。該方法采用Gaussian軟件和Autodock對接軟件在普通計算機(jī)上對金屬配合物與DNA的相互作用進(jìn)行模擬。首先在Gaussian軟件中對金屬配合物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化，作為配體分子；然后在AutoDock軟件中進(jìn)行金屬配合物與DNA的分子對接，最后將對接結(jié)果進(jìn)行分析。本發(fā)明方法不需要借助于大型計算機(jī)服務(wù)器，在普通計算機(jī)上即可運行，設(shè)備成本很低，計算過程中所需要的CPU核數(shù)低，占用內(nèi)存小，整個計算的過程所用時間很短而且模擬結(jié)果可靠，有助于在生物化學(xué)、配位化學(xué)、生物醫(yī)藥等領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。