本發(fā)明提供了一種應(yīng)用于酵母細胞中HCP殘留的去除方法，屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明對酵母細胞液進行陽離子層析、疏水層析、CHT層析、陽離子層析后，用HCP檢測試劑盒檢測HCP殘留。本發(fā)明通過對工藝路線和參數(shù)的優(yōu)化，去除酵母中HCP殘留，尤其是酵母胞外表達的蛋白，雖然沒有細胞破碎這一步驟，但是可以針對目前很多由于HCP和目的蛋白化學(xué)性質(zhì)相近，比如等電點和分子量等因素，導(dǎo)致不容易去除HCP的問題，本發(fā)明對于該問題的解決方法進行開發(fā)，以便將殘留濃度降至100ppm(ng/mg)以內(nèi)，達到相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)。本發(fā)明解決了目前發(fā)酵液中普遍存在HCP殘留較多，并難以去除的問題，所得效果顯著。