本發(fā)明公開了一種縱向雙腔原子氣室及其制備方法，由玻璃、硅片、玻璃依次鍵合而成；所述原子氣室包括設(shè)在上層玻璃和硅片之間的上層氣室，與上層氣室相連通、刻蝕在硅片上的用于吹制上層氣室的凹槽，刻蝕在下層玻璃上的反應(yīng)室，與凹槽、反應(yīng)室向連通的過濾通道；所述凹槽的深度小于硅片的厚度；過濾通道包括刻蝕在硅片上的第一通道。本發(fā)明在化學(xué)反應(yīng)填充技術(shù)的基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)了上檢測(cè)下反應(yīng)的縱向雙氣腔結(jié)構(gòu)，在保留定量配比的同時(shí)，縱向結(jié)構(gòu)優(yōu)化了氣室占地空間大小；縱向的結(jié)構(gòu)也會(huì)使得重力限制生成的雜質(zhì)向上層檢測(cè)氣室流通。