一種水體中微生物DNA的提取方法，采用無菌微孔濾膜收集微生物，利用物理和化學(xué)方法破碎微生物細胞，其次采用醋酸鉀、異硫氰酸胍、檸檬酸鈉等試劑去除腐殖酸等雜質(zhì)，將細胞裂解液進行多次離心純化，最后用乙醇和醋酸鉀抽提后得到純化的微生物基因組DNA，所提取的微生物DNA具有較好的完整性，純度高，產(chǎn)量高，其OD260/OD280比值在1.8～2.0之間，經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后染色，DNA條帶清晰且單一，無拖尾，無雜帶，獲得的微生物DNA產(chǎn)量高、操作簡單、成本低，提取過程無需再純化，縮減了提取步驟，降底了提取成本，適用于各種水體微生物的多樣性分析。