本發(fā)明提供一種二級反滲透系統(tǒng)入口pH值的自動控制方法及控制系統(tǒng)，屬于化學水處理技術領域。其中，控制方法包括：檢測二級反滲透系統(tǒng)入口的pH值；將pH值與預設pH值做減法運算，并取運算結果的絕對值，以得到pH差值；將pH差值與預設pH差值進行比較；根據比較結果將加堿計量泵按預設頻率輸出或調整加堿計量泵的輸出頻率，以使得二級反滲透系統(tǒng)入口pH值維持在預設區(qū)間。本發(fā)明的控制方法可實現(xiàn)對二級反滲透系統(tǒng)入口pH值的自動控制，控制過程簡單，并可以減少運行人員的操作量。