本發(fā)明公開了一種基于近紅外顯微成像技術(shù)的棉粕中抗生素菌渣的判別方法，所述方法包括如下步驟：(1)對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)處理；(2)對(duì)預(yù)處理后的樣品進(jìn)行可見光圖像和近紅外顯微圖像的采集；(3)對(duì)上述采集的近紅外顯微圖像中特定區(qū)域的近紅外光譜進(jìn)行提取、預(yù)處理和光譜特征峰的篩選；(4)將篩選出的光譜特征峰的數(shù)據(jù)建立定性判別模型，采用所述定性判別模型對(duì)待檢樣品進(jìn)行判別是否含有抗生素菌渣。本發(fā)明的方法，基于近紅外顯微成像技術(shù)進(jìn)行判別，通過結(jié)合化學(xué)計(jì)量學(xué)方法建立適宜于棉粕中抗生素菌渣判別的近紅外光譜模型，能高效、準(zhǔn)確的判別棉粕中的抗生素菌渣。