本實用新型屬于實驗室用化學(xué)儀器領(lǐng)域，特別是涉及一種恒溫微型厭氧發(fā)酵裝置，包括恒溫水浴鍋、放置在恒溫水浴鍋內(nèi)的多個微型厭氧發(fā)酵瓶、盛有飽和食鹽水的氣體收集瓶以及連接微型厭氧發(fā)酵瓶以及氣體收集瓶的雙向針頭連接器；雙向針頭連接器包括設(shè)置在飽和食鹽水液面下的第一針頭、設(shè)置在微型厭氧發(fā)酵瓶中發(fā)酵液的液面上方的第二針頭以及連接第一針頭與第二針頭之間的導(dǎo)氣管；恒溫水浴鍋內(nèi)設(shè)置有用于固定微型厭氧發(fā)酵瓶的箱體。本實用新型可以定時或隨時取下一定數(shù)目的發(fā)酵瓶，終止發(fā)酵，實時觀測底物殘渣降解情況和發(fā)酵液中相關(guān)指標(biāo)及微生物多樣性的動態(tài)變化。