本發(fā)明屬于生物信息領(lǐng)域，涉及一種DNA測序數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)存儲方式FASTQ格式文件無損壓縮的方法。首先，將原FASTQ文件按序列進行提取，第三行丟棄。然后，將提取的序列按照行重新生成新的文件，分別為保存第一行的序列標(biāo)志文件、保存第二行的序列數(shù)據(jù)文件和保存第四行的質(zhì)量評分文件。其次，對第二步生成的三個文件分別利用進行壓縮處理：對序列數(shù)據(jù)文件進行壓縮、對質(zhì)量評分文件進行壓縮、將序列標(biāo)志文件進行處理之后再進行壓縮。最后，對第三步生成的壓縮文件，用tar將其壓縮為一個文件，并且刪除中間過程文件。通過本發(fā)明方法可以對下一代測序技術(shù)產(chǎn)生的海量DNA測序數(shù)據(jù)進行經(jīng)濟性存儲和快速傳輸。