本發(fā)明公開了一種種子單籽粒無損檢測方法及系統(tǒng)，屬于光譜檢測技術(shù)領(lǐng)域，所述方法包括以下步驟：S1：對待檢測種子被近紅外光源發(fā)出的近紅外光照射時的第一漫透射光譜進行采集；S2：對所述第一漫透射光譜按照預(yù)設(shè)的預(yù)處理方式進行預(yù)處理；S3：對預(yù)處理后的第一漫透射光譜按照預(yù)設(shè)的特征提取方式進行特征提取，以獲得第一光譜特征；S4：根據(jù)所述第一光譜特征通過品種模型確定所述待檢測種子的品種。本發(fā)明根據(jù)待檢測種子的漫透射光譜來確定其品種，由于在測量漫透射光譜時，近紅外光能夠通過完整籽粒，故而可采集籽粒的整體信息，并且大幅降低了種子的擺放位置對光譜質(zhì)量的影響，提高了檢測的穩(wěn)定性。