本發(fā)明公開了一種改性聚氨酯防水防腐表面處理劑及其制備方法和應(yīng)用，屬于有機高分子復(fù)合材料領(lǐng)域，該處理劑的結(jié)構(gòu)式：[(RO)3Si-CH2CH2CH2]a-PU-[X-Rf]b，其中，PU為聚硅氧烷型聚氨酯，Rf為4-6個碳原子的全氟烷基鏈段，X為二價有機連接基團，R為甲基或乙基，a＝0～6，b＝1～6；制備方法：在聚合催化劑作用下，多異氰酸酯與雙碳羥基封端聚硅氧烷在有機溶劑中反應(yīng)生成NCO封端預(yù)聚體，再經(jīng)擴鏈后與氟碳鏈長為4-6的全氟烷基醇和硅烷偶聯(lián)劑進行封端反應(yīng)即得。本發(fā)明的處理劑用于各種水下建筑、跨海大橋、海底承臺以及各種艦船的防水防腐處理，具有優(yōu)異的滲透性、耐候性和穩(wěn)定的防水防腐性能。